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+ ---
2
+ language: es
3
+ tags:
4
+ - biomedical
5
+ - clinical
6
+ - spanish
7
+ - bsc-bio-ehr-es
8
+ license: apache-2.0
9
+ datasets:
10
+ - "PlanTL-GOB-ES/pharmaconer"
11
+ metrics:
12
+ - f1
13
+
14
+ model-index:
15
+ - name: IIC/bsc-bio-ehr-es-pharmaconer
16
+ results:
17
+ - task:
18
+ type: token-classification
19
+ dataset:
20
+ name: pharmaconer
21
+ type: PlanTL-GOB-ES/pharmaconer
22
+ split: test
23
+ metrics:
24
+ - name: f1
25
+ type: f1
26
+ value: 0.904
27
+ pipeline_tag: token-classification
28
+ widget:
29
+ - text: "Se realizó estudio analítico destacando incremento de niveles de PTH y vitamina D (103,7 pg/ml y 272 ng/ml, respectivamente), atribuidos al exceso de suplementación de vitamina D."
30
+ - text: " Por el hallazgo de múltiples fracturas por estrés, se procedió a estudio en nuestras consultas, realizándose análisis con función renal, calcio sérico y urinario, calcio iónico, magnesio y PTH, que fueron normales."
31
+ - text: "Se solicitó una analítica que incluía hemograma, bioquímica, anticuerpos antinucleares (ANA) y serologías, examen de orina, así como biopsia de la lesión. Los resultados fueron normales, con ANA, anti-Sm, anti-RNP, anti-SSA, anti-SSB, anti-Jo1 y anti-Scl70 negativos."
32
+
33
+ ---
34
+
35
+ # bsc-bio-ehr-es-pharmaconer
36
+
37
+ This model is a finetuned version of bsc-bio-ehr-es for the pharmaconer dataset used in a benchmark in the paper TODO. The model has a F1 of 0.904
38
+
39
+ Please refer to the original publication for more information TODO LINK
40
+
41
+ ## Parameters used
42
+
43
+ | parameter | Value |
44
+ |-------------------------|:-----:|
45
+ | batch size | 16 |
46
+ | learning rate | 4e-05 |
47
+ | classifier dropout | 0.1 |
48
+ | warmup ratio | 0 |
49
+ | warmup steps | 0 |
50
+ | weight decay | 0 |
51
+ | optimizer | AdamW |
52
+ | epochs | 10 |
53
+ | early stopping patience | 3 |
54
+
55
+
56
+ ## BibTeX entry and citation info
57
+
58
+ ```bibtex
59
+ TODO
60
+ ```
61
+