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The dataset generation failed because of a cast error
Error code: DatasetGenerationCastError
Exception: DatasetGenerationCastError
Message: An error occurred while generating the dataset
All the data files must have the same columns, but at some point there are 1 new columns ({'frequency_all_disciplines'}) and 1 missing columns ({'frequency'}).
This happened while the csv dataset builder was generating data using
hf://datasets/SINAI/spanish-acronyms-pubmed/2-Inter-frequency_frequency_acronym_all_disciplines.csv (at revision 545ddc27829b98fffaad6539d7a28c580494df07)
Please either edit the data files to have matching columns, or separate them into different configurations (see docs at https://hf.co/docs/hub/datasets-manual-configuration#multiple-configurations)
Traceback: Traceback (most recent call last):
File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/builder.py", line 2011, in _prepare_split_single
writer.write_table(table)
File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/arrow_writer.py", line 585, in write_table
pa_table = table_cast(pa_table, self._schema)
File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/table.py", line 2302, in table_cast
return cast_table_to_schema(table, schema)
File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/table.py", line 2256, in cast_table_to_schema
raise CastError(
datasets.table.CastError: Couldn't cast
pair: string
acronym: string
description: string
frequency_all_disciplines: int64
-- schema metadata --
pandas: '{"index_columns": [{"kind": "range", "name": null, "start": 0, "' + 753
to
{'pair': Value(dtype='string', id=None), 'acronym': Value(dtype='string', id=None), 'description': Value(dtype='string', id=None), 'frequency': Value(dtype='int64', id=None)}
because column names don't match
During handling of the above exception, another exception occurred:
Traceback (most recent call last):
File "/src/services/worker/src/worker/job_runners/config/parquet_and_info.py", line 1321, in compute_config_parquet_and_info_response
parquet_operations = convert_to_parquet(builder)
File "/src/services/worker/src/worker/job_runners/config/parquet_and_info.py", line 935, in convert_to_parquet
builder.download_and_prepare(
File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/builder.py", line 1027, in download_and_prepare
self._download_and_prepare(
File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/builder.py", line 1122, in _download_and_prepare
self._prepare_split(split_generator, **prepare_split_kwargs)
File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/builder.py", line 1882, in _prepare_split
for job_id, done, content in self._prepare_split_single(
File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/builder.py", line 2013, in _prepare_split_single
raise DatasetGenerationCastError.from_cast_error(
datasets.exceptions.DatasetGenerationCastError: An error occurred while generating the dataset
All the data files must have the same columns, but at some point there are 1 new columns ({'frequency_all_disciplines'}) and 1 missing columns ({'frequency'}).
This happened while the csv dataset builder was generating data using
hf://datasets/SINAI/spanish-acronyms-pubmed/2-Inter-frequency_frequency_acronym_all_disciplines.csv (at revision 545ddc27829b98fffaad6539d7a28c580494df07)
Please either edit the data files to have matching columns, or separate them into different configurations (see docs at https://hf.co/docs/hub/datasets-manual-configuration#multiple-configurations)Need help to make the dataset viewer work? Make sure to review how to configure the dataset viewer, and open a discussion for direct support.
pair
string | acronym
string | description
string | frequency
int64 |
|---|---|---|---|
('SEICAP', 'sociedad española de inmunología clínica y alergología pediátrica') | SEICAP | sociedad española de inmunología clínica y alergología pediátrica | 1 |
('ACE', 'antígeno carcinoembrionario') | ACE | antígeno carcinoembrionario | 2 |
('EMRR', 'em remitente recurrente') | EMRR | em remitente recurrente | 1 |
('SETH', 'sociedad española de trasplante hepático') | SETH | sociedad española de trasplante hepático | 1 |
('VBH', 'virus b de la hepatitis') | VBH | virus b de la hepatitis | 1 |
('IFN-gamma', 'interferon gamma') | IFN-gamma | interferon gamma | 1 |
('VHC', 'virus de la hepatitis c') | VHC | virus de la hepatitis c | 1 |
('IEOFR', 'inmuno-electro-osmo-foresis radial') | IEOFR | inmuno-electro-osmo-foresis radial | 1 |
('T.P.I.', 'treponemica de nelson') | T.P.I. | treponemica de nelson | 1 |
('L.E.S.', 'lupus eritematoso sistémico') | L.E.S. | lupus eritematoso sistémico | 1 |
('SEIMC', 'sociedad española de enfermedades infecciosas y microbiología clínica') | SEIMC | sociedad española de enfermedades infecciosas y microbiología clínica | 1 |
('RHA', 'reacción de hemaglutinación indirecta') | RHA | reacción de hemaglutinación indirecta | 1 |
('EIA', 'enzimoinmunoanálisis') | EIA | enzimoinmunoanálisis | 1 |
('IEF', 'inmunoelectroforesis') | IEF | inmunoelectroforesis | 1 |
('AT', 'autotrasplante') | AT | autotrasplante | 1 |
('IL-10', 'interleucina 10') | IL-10 | interleucina 10 | 1 |
('E12', 'españa 0012') | E12 | españa 0012 | 1 |
('ICAM-1', 'intercelular-1') | ICAM-1 | intercelular-1 | 1 |
('as', 'agricultores y sus compañeros') | as | agricultores y sus compañeros | 1 |
('IFI', 'inmunofluorescencia indirecta') | IFI | inmunofluorescencia indirecta | 3 |
('CN', 'complicaciones neurologicas') | CN | complicaciones neurologicas | 1 |
('RH"', 'rh segunda') | RH" | rh segunda | 1 |
('MGMT', 'metilguanina-adn-metiltransferasa') | MGMT | metilguanina-adn-metiltransferasa | 1 |
('AcMo', 'anticuerpo monoclonal') | AcMo | anticuerpo monoclonal | 1 |
('SEPAR', 'sociedad española de neumología y cirugía torácica') | SEPAR | sociedad española de neumología y cirugía torácica | 1 |
('M-PTH', 'media de hormona parathiroidea') | M-PTH | media de hormona parathiroidea | 1 |
('VIH', 'virus de immunodeficiencia humana') | VIH | virus de immunodeficiencia humana | 1 |
('EF', 'encefalolitógeno humano') | EF | encefalolitógeno humano | 1 |
('C/T', 'cociente psa:alpha 1 antiquimotripsina/psa total') | C/T | cociente psa:alpha 1 antiquimotripsina/psa total | 1 |
('RHAI', 'reacción de hemaglutinación indirecta') | RHAI | reacción de hemaglutinación indirecta | 1 |
('CHMSS', 'complejo hospitalario metropolitano del seguro social') | CHMSS | complejo hospitalario metropolitano del seguro social | 1 |
('CIE', 'contrainmunoelectroforesis') | CIE | contrainmunoelectroforesis | 1 |
('DCI', 'desnutrición crónica infantil') | DCI | desnutrición crónica infantil | 1 |
('CEA', 'carcinoembrionario') | CEA | carcinoembrionario | 3 |
('NGPP', 'neisseria gonorrhoeae productoras de penicilinasa') | NGPP | neisseria gonorrhoeae productoras de penicilinasa | 1 |
('GENTE', 'grupo de estudio de nuevas terapias de enfermedades reumáticas') | GENTE | grupo de estudio de nuevas terapias de enfermedades reumáticas | 1 |
('PIVh', 'parainfluenza virus humano') | PIVh | parainfluenza virus humano | 1 |
('IEOF-ID', 'inmunoelectroosmoforesis-inmunodifusion') | IEOF-ID | inmunoelectroosmoforesis-inmunodifusion | 1 |
('AcM', 'anticuerpos monoclonales') | AcM | anticuerpos monoclonales | 1 |
('HVB', 'hepatitis vírica tipo b') | HVB | hepatitis vírica tipo b | 1 |
('DB', 'de basófilos') | DB | de basófilos | 1 |
('RIA', 'radioinmunoensayo') | RIA | radioinmunoensayo | 1 |
('PDF', 'productos de degradación del fibrinógeno') | PDF | productos de degradación del fibrinógeno | 1 |
('RAHP', 'receptores frente a albúmina humana polimerizada') | RAHP | receptores frente a albúmina humana polimerizada | 1 |
('TASPE', 'trasplante autólogo de progenitores hematopoyéticos de sangre periférica') | TASPE | trasplante autólogo de progenitores hematopoyéticos de sangre periférica | 1 |
('GEIDAC', 'grupo español de investigación en dermatitis de contacto y alergia cutánea') | GEIDAC | grupo español de investigación en dermatitis de contacto y alergia cutánea | 1 |
('PCNA', 'proliferacion celular') | PCNA | proliferacion celular | 1 |
('Au', 'australiano') | Au | australiano | 1 |
('EMPP', 'em primariamente progresiva') | EMPP | em primariamente progresiva | 1 |
('VHC', 'virus hepatitis c') | VHC | virus hepatitis c | 1 |
('MAT', 'microaglutinación') | MAT | microaglutinación | 1 |
('RFB', 'reacción de floculación con bentonita') | RFB | reacción de floculación con bentonita | 1 |
('SNEM', 'servicio nacional de erradicación de la malaria') | SNEM | servicio nacional de erradicación de la malaria | 1 |
('TR', 'termorresistente de leptospira') | TR | termorresistente de leptospira | 1 |
('URO', 'urogastrona') | URO | urogastrona | 1 |
('A.R.', 'artritis reumatoidea') | A.R. | artritis reumatoidea | 1 |
('Tg', 'tiroglobulina') | Tg | tiroglobulina | 1 |
('VHB', 'virus de la hepatitis b') | VHB | virus de la hepatitis b | 2 |
('IFN', 'interferon alfa-2b') | IFN | interferon alfa-2b | 1 |
('NCC', 'neurocisticercosis') | NCC | neurocisticercosis | 1 |
('E C', 'enfermedad celiaca') | E C | enfermedad celiaca | 1 |
('VIH', 'virus de la inmunodeficiencia humana') | VIH | virus de la inmunodeficiencia humana | 9 |
('Hp', 'helicobacter pylori') | Hp | helicobacter pylori | 1 |
('r.i.a.', 'radioinmunoanálisis') | r.i.a. | radioinmunoanálisis | 1 |
('RHR', 'respuesta immune de hipersensibilidad retardada') | RHR | respuesta immune de hipersensibilidad retardada | 1 |
('PCNA', 'proliferación celular') | PCNA | proliferación celular | 1 |
('VIH-2', 'virus de la inmunodeficiencia humana tipo 2') | VIH-2 | virus de la inmunodeficiencia humana tipo 2 | 1 |
('GEDSRT-VHC', 'grupo español de estudio de donantes de sangre en riesgo de transmisión del vhc') | GEDSRT-VHC | grupo español de estudio de donantes de sangre en riesgo de transmisión del vhc | 1 |
('ETEC', 'enterotoxigénica') | ETEC | enterotoxigénica | 1 |
('VPH', 'virus del papiloma humano') | VPH | virus del papiloma humano | 1 |
('RIA', 'radioinmunoanálisis') | RIA | radioinmunoanálisis | 1 |
('LPS', 'lipopolisacárido') | LPS | lipopolisacárido | 1 |
('ZBS', 'zonas básicas de salud') | ZBS | zonas básicas de salud | 1 |
('Hib', 'haemophilus influenzae tipo b') | Hib | haemophilus influenzae tipo b | 1 |
('ARIA', 'alérgica y su impacto en el asma') | ARIA | alérgica y su impacto en el asma | 1 |
('VPH', 'virus papiloma humano') | VPH | virus papiloma humano | 1 |
('RFCE', 'receptor del factor de crecimiento epidérmico') | RFCE | receptor del factor de crecimiento epidérmico | 1 |
('LAM', 'leucemia aguda mieloide') | LAM | leucemia aguda mieloide | 1 |
('GNRP', 'glomerulonefritis rápidamente progresivas') | GNRP | glomerulonefritis rápidamente progresivas | 1 |
('RIE', 'radioinmunoensayo') | RIE | radioinmunoensayo | 1 |
('CTAT', 'complejos trombina-antitrombina iii') | CTAT | complejos trombina-antitrombina iii | 1 |
('AEHH', 'asociación española de hematolgía y hemoterapia') | AEHH | asociación española de hematolgía y hemoterapia | 1 |
('VHC', 'virus de hepatitis c') | VHC | virus de hepatitis c | 1 |
('ECA', 'enterobacterias') | ECA | enterobacterias | 2 |
('GETH', 'grupo español de trasplante hemopoyético') | GETH | grupo español de trasplante hemopoyético | 1 |
('MRV', 'monitoreo rápido de vacunación') | MRV | monitoreo rápido de vacunación | 1 |
('FHD', 'fiebre hemorrágica por dengue') | FHD | fiebre hemorrágica por dengue | 1 |
('HSV-2', 'herpes simple-2') | HSV-2 | herpes simple-2 | 1 |
('CPH', 'cáncer primitivo del higado') | CPH | cáncer primitivo del higado | 1 |
('ARP', 'activadad de renina plasmática') | ARP | activadad de renina plasmática | 1 |
('PV', 'pentavalente') | PV | pentavalente | 1 |
('VAG', 'vacunación antigripal') | VAG | vacunación antigripal | 1 |
('UITB', 'unidad de investigación en tuberculosis de barcelona') | UITB | unidad de investigación en tuberculosis de barcelona | 2 |
('CAP', 'centros de atención primaria') | CAP | centros de atención primaria | 1 |
('VIH-1', 'virus de inmunodeficiencia human tipo 1') | VIH-1 | virus de inmunodeficiencia human tipo 1 | 1 |
('RR', 'riesgos relativos') | RR | riesgos relativos | 1 |
('MLC', 'mixto de linfocitos') | MLC | mixto de linfocitos | 1 |
('gtc', 'globulina transportadora de corticoides') | gtc | globulina transportadora de corticoides | 1 |
('NPA', 'nefropatía secundaria a púrpura anafilactoide') | NPA | nefropatía secundaria a púrpura anafilactoide | 1 |
('GETECCU', 'grupo español de trabajo en enfermedad de crohn y colitis ulcerosa') | GETECCU | grupo español de trabajo en enfermedad de crohn y colitis ulcerosa | 1 |
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