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1
+ ---
2
+ language:
3
+ - ja
4
+ license:
5
+ - cc-by-4.0
6
+ tags:
7
+ - NER
8
+ - medical documents
9
+ datasets:
10
+ - MedTxt-CR-JA-training-v2.xml
11
+ metrics:
12
+ - NTCIR-16 Real-MedNLP subtask 1
13
+ ---
14
+
15
+
16
+ This is a model for named entity recognition of Japanese medical documents.
17
+
18
+ ### How to use
19
+
20
+ Download the following five files and put into the same folder.
21
+ - id_to_tags.pkl
22
+ - key_attr.pkl
23
+ - text.txt
24
+ - NER_medNLP.py
25
+ - predict.py
26
+
27
+ You can use this model by running predict.py.
28
+
29
+ ```
30
+ python3 predict.py
31
+ ```
32
+
33
+ ### Input Example
34
+
35
+ ```
36
+ 肥大型心筋症、心房細動に対してWF投与が開始となった。
37
+ 治療経過中に非持続性心室頻拍が認められたためアミオダロンが併用となった。
38
+ ```
39
+
40
+ ### Output Example
41
+
42
+ ```
43
+ <d certainty="positive">肥大型心筋症、心房細動</d>に対して<m-key state="executed">WF</m-key>投与が開始となった。
44
+ <timex3 type="med">治療経過中</timex3>に<d certainty="positive">非持続性心室頻拍</d>が認められたため<m-key state="executed">アミオダロン</m-key>が併用となった。
45
+ ```